El grupo se enfoca a estudiar caracteres importantes para la producción de especies de agave para la producción de bebidas alcohólicas, producción de inulinas y potencialmente producción de bioenergía. Los fructanos almacenados en el tallo de las plantas de agave son la materia prima para estos productos y es esencial entender a nivel genético-molecular el metabolismo de su síntesis y degradación además de su localización espacio temporal y sus papeles la fotosíntesis CAM, la suculencia y las respuestas a estrés y microorganismos. Otro carácter muy importante para la producción eficiente de plantas de agave es el proceso de transición entre la etapa vegetativa y la etapa reproductiva. Este proceso puede iniciar entre las 5 o 50 años de edad de la planta dependiendo de la especie y señala el fin de la vida de la planta. La transición en agaves cultivados indica que la planta ya esta lista para ser jimada, sin embargo en el campo la floración es muy heterogéneo y el manejo de la plantas en esta etapa requiere gastos en tiempo y dinero.

Un mejor comprensión de los factores que conducen a la transición vegetativa/reproductiva permitirá un manejo agronómico más eficiente y abrirá la posibilidad de implementar esquemas de mejoramiento en agave. La estrategias que hemos desarrollados son similares para ambos líneas de trabajo: buscar genes candidatos basado en análisis a nivel de transcriptoma, seguida por la caracterización de estos candidatos in sílico e in vivo y a nivel fisiológico en sistemas heterólogos.