Nuestro interés general es entender los procesos moleculares que han llevado a la gran complejidad y diversidad de los seres vivos. El primer aspecto en el que estamos interesados es la evolución de la regulación génica. Nuestro objetivo es entender cómo los cambios en el momento y en las condiciones en las que se expresa un gen pueden llevar a la generación de nuevas características a través del tiempo. Nuestros estudios son principalmente a nivel genómico ya que creemos que estudiar fenómenos biológicos en su totalidad generará conocimientos que reflejarán de mejor manera los sistemas naturales. Como organismo modelo utilizamos las levaduras ascomicetas, ya que estas abarcan un amplio rango evolutivo, muestran diferencias fenotípicas graduales, y los recursos moleculares y genómicos para su estudio son extensos. Lo anterior nos lleva al segundo interés del grupo, entender cómo evolucionan las poblaciones silvestres de levaduras ascomicetas. A pesar de ser excelentes organismos modelo y tener una estrecha relación con el humano, es poco lo que se sabe sobre la historia natural de las levaduras ascomicetas, especialmente en México. Utilizando técnicas de genómica microbiana, queremos entender la diversidad, distribución y dinámica de estos microorganismos en sus nichos naturales. Nuestro trabajo nos llevará a entender los procesos básicos por los que los organismos cambian a través del tiempo y también nos permitirá diseñar mejores estrategias para su conservación.

Evolución de las poblaciones silvestres de levaduras en México.

Las levaduras ascomicetas, además de ser excelentes organismos modelo para el estudio de la biología molecular y evolutiva, tienen una estrecha relación con el humano. Por un lado, han sido utilizadas desde hace miles de años para la elaboración de alimentos (como pan y bebidas fermentadas) y actualmente son esenciales en procesos biotecnológicos para la síntesis de substancias de interés comercial. Por el otro lado, varias especies de levaduras ascomicetas son patógenos comunes de humanos y patógenos de plantas de relevancia agrícola como el algodón o los cítricos. A pesar de su importancia, es poco lo que se sabe sobre la historia natural de estos organismos. Utilizando técnicas de genómica microbiana como la secuenciación de genomas y metagenomas, queremos entender la diversidad, distribución y dinámica de estos organismos en sus nichos naturales. Por ejemplo, estamos interesados en analizar la diversidad de especies de levadura en la producción tradicional de destilados de agave ya que la fermentación en este proceso es llevada a cabo por levaduras silvestres que no son inoculadas por los productores.