Bioinformática y Redes Complejas

LABORATORIO

INVESTIGACIONES ACTUALES

Líneas de Investigación

En el grupo de Bioinformática y Redes Complejas, nos interesa el desarrollo de métodos y algoritmos para la reconstrucción evolutiva de familias de genes, proteínas, y otras entidades biológicas, tales como RNAs no codificantes. También utilizamos el análisis de redes para entender las interacciones microbianas, ecológicas, genómicas a diferentes escalas biológicas.

MaribelHernandez

Maribel Hernández Rosales
Investigador Principal

KatiaAviña_Maribel Hernandez Ro

Katia Aviña Padilla
Investigadora Posdoctoral

MujerGris

Ariana Escalante Kantún
Investigadora Asociada

MujerGris

Dulce Irene Valdivia Martínez
Investigadora Asociada

MujerGris

Andrea Torres Calderón
Investigadora Asociada

MujerGris

Andrea Arlette España
Estancia de Investigación

68

Janeth de Anda Gil
Estudiante de Doctorado

36

Anish Ganju
Estudiante de Doctorado
(Codirección con la Dra. Gabriela Olmedo)

70

Carlos Andrés Cifuentes García
Estudiante de Maestría

67

 Irecha Cano Pantoja
Estudiante de Maestría

61

Luis Fernando Flores López
Estudiante de Maestría
(Codirección con el Dr. Víctor Olalde)

35

Marisol Navarro Miranda
Estudiante de Maestría
(Codirección con la Dra. Gabriela Olmedo)

71

José Antonio Ramírez Rafael
Estudiante de Maestría

65

Octavio Zambada Moreno
Estudiante de Maestría

PersonaGris

Dan Jinich Fainsod
Estudiante de Licenciatura

PersonaGris

Mauricio Vueltiflor Gil
Estudiante de Licenciatura

  • Aviña-Padilla, K.; Zambada-Moreno, O.; Herrera-Oropeza, G.E.; Jimenez-Limas, M.A.; Abrahamian, P.; Hammond, R.W.; Hernández-Rosales, M. Insights into the Transcriptional Reprogramming in Tomato Response to PSTVd Variants Using Network Approaches. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 5983. https://doi.org/10.3390/ijms23115983
  • Aviña-Padilla, K. et al. (2022). Deciphering the Tissue-Specific Regulatory Role of Intronless Genes Across Cancers. In: Jin, L., Durand, D. (eds) Comparative Genomics. RECOMB-CG 2022. Lecture Notes in Computer Science(), vol 13234. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-06220-9_18
  • Aviña-Padilla K, Ramírez-Rafael JA, Herrera-Oropeza GE, Muley VY, Valdivia DI, Díaz-Valenzuela E, García-García A, Varela-Echavarría A and Hernández-Rosales M (2021) Evolutionary Perspective and Expression Analysis of Intronless Genes Highlight the Conservation of Their Regulatory Role. Front. Genet. 12:654256. doi: 10.3389/fgene.2021.654256
  • Hernandez-Rosales, M., Hellmuth, M., Wieseke, N. et al. From event-labeled gene trees to species trees. BMC Bioinformatics 13 (Suppl 19), S6 (2012). https://doi.org/10.1186/1471-2105-13-S19-S6
  • Marcus Lechner, Maribel Hernandez-Rosales, Daniel Doerr, Nicolas Wieseke, Annelyse Thevenin, Jens Stoye, Sonja J. Prohaska and Peter F. Stadler. Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Data Sets. PlosONE, 9(8):e105015, (2014).

Si eres mujer o estás en el grupo de minorías y te gusta la programación, el Laboratorio de Bioinformática y Redes Complejas te invita a hacer estancias de investigación, tesis de licenciatura, maestría, doctorado, o servicio social. Personas del área de Ciencias Exactas, las invitamos a unirse a nuestro grupo.