Biología Molecular y Ecología Microbiana

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Líneas de Investigación

Genómica, ecología y evolución de las bacterias.

El interés de mi grupo es entender cómo diferentes bacterias pueden llegar a coexistir y formar comunidades. Adicionalmente y más allá del ensamblaje de componentes individuales, la pregunta fundamental es cómo surgen sistemas complejos a partir de unos pocos componentes. Las comunidades sintéticas permiten abordar la dinámica y los mecanismos de interacciones microbianas complejas al tiempo que permiten reducir y controlar la cantidad de variables, desde la cantidad de individuos que interactúan, los factores abióticos y, de manera crítica, el momento de los experimentos. La mayoría de los estudios sobre interacciones microbianas se realizan en lapsos de horas e incluso días, pero los microbios deben poder detectar el peligro en segundos y establecer una respuesta de defensa, por lo que nuestro enfoque incluye entender la respuesta inmediata (minutos).

Mi grupo se ha enfocado principalmente al estudio de bacterias del filum Bacillota (anteriormente Firmicutes), en particular de comunidades microbianas en sistemas acuáticos de Cuatro Ciénegas, Coahuila, México. Usando enfoques de microbiología clásica, evolución experimental y “ómicas”, hemos descubierto rasgos que explican su historia evolutiva y adaptaciones. Con mis colaboradores, también hemos emprendido estrategias de modelado matemático y metagenómica.

GabrielaOlmedo

Gabriela Olmedo
Investigador Principal

40

Africa Islas Robles
Auxiliar de Investigación

PersonaGris

Oscar Gallardo
Posdoctorado

44

Gerardo Ruiz Amores
Posdoctorado

34

José Norberto García Miranda
Estudiante de Doctorado
(Codirección con el Dr. Luis Delaye)

36

Anish Gupta
Estudiante de Doctorado
(Codirección con la Dra. Maribel Hernández)

Bernardo_Salinas

Bernardo Aguilar Salinas
Estudiante de Doctorado

35

Marisol Navarro Miranda
Estudiante de Maestría
(Codirección con la Dra. Maribel Hernández)

PersonaGris

Iván Anguiano Aguirre
Estudiante de Maestría

39

Patricia Soria Venegas
Estudiante de Maestría

42

Emmanuel Cordero Martínez
Estudiante de Maestría

PersonaGris

Leonardo Meléndez Cerda
Estudiante de Licenciatura

37

Oscar Bladimir Villegas
Estudiante de Licenciatura

38

Brian Valencia González
Estudiante de Licenciatura

41

Eliane Giovanna Piñón Salinas
Estancia

43

José Manuel Juárez Serrano
Practicas profesionales

  • Enrique Hurtado Bautista, Laura F. Pérez Sánchez, África Islas Robles, Gustavo Santoyo and Gabriela Olmedo Alvarez. Phenotypic plasticity and evolution of thermal tolerance in bacteria from temperate and hot spring environments. Peer J (9): 1-24: 2021. DOI 10.7717/peerj.11734
  • Ismael L Hernandez-Gonzalez, Gabriel Moreno-Hagelsieb and Gabriela Olmedo– Environmentally-driven gene content convergence and the Bacillus phylogeny. 2018. BMC Evolutionary Biology, BMC Evolutionary Biology (1)148. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30285626
  • Souza, A. Moreno-Letelier, M. Travisano, L. D. Alcaraz, G. Olmedo-Alvarez , L. E. Eguiarte. The lost world of Cuatro Cienegas Basin, a relictual bacterial niche in a desert oasis. eLife7 (2018): e38278. eLIFE eLife 7 (2018): e38278 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30457104
  • Jose Antonio González-Gutiérrez, Diana F. Diaz-Jimenez, Itzel Vargas-Peréz, Gabriel Guillen-Solis, Jörg Stülke, Gabriela Olmedo-Alvarez. The DEAD-box RNA helicases of Bacillus subtilis as a model to evaluate genetic compensation among duplicate genes. 2018. Frontiers in Microbiology, section Evolutionary and Genomic Microbiology. Frontiers in microbiology, 9. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6178137/
  • Tapia-Torres, y Gabriela Olmedo-Álvarez. Life on phosphite: A metagenomics tale Spotlight. Trends in Microbiology. 26, no. 3 (2018): 170-172. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29402580/