Biología Molecular y Ecología Microbiana
LABORATORIO
INVESTIGACIONES ACTUALES
Líneas de Investigación
Genómica, ecología y evolución de las bacterias.
El interés de mi grupo es entender cómo diferentes bacterias pueden llegar a coexistir y formar comunidades. Adicionalmente y más allá del ensamblaje de componentes individuales, la pregunta fundamental es cómo surgen sistemas complejos a partir de unos pocos componentes. Las comunidades sintéticas permiten abordar la dinámica y los mecanismos de interacciones microbianas complejas al tiempo que permiten reducir y controlar la cantidad de variables, desde la cantidad de individuos que interactúan, los factores abióticos y, de manera crítica, el momento de los experimentos. La mayoría de los estudios sobre interacciones microbianas se realizan en lapsos de horas e incluso días, pero los microbios deben poder detectar el peligro en segundos y establecer una respuesta de defensa, por lo que nuestro enfoque incluye entender la respuesta inmediata (minutos).
Mi grupo se ha enfocado principalmente al estudio de bacterias del filum Bacillota (anteriormente Firmicutes), en particular de comunidades microbianas en sistemas acuáticos de Cuatro Ciénegas, Coahuila, México. Usando enfoques de microbiología clásica, evolución experimental y “ómicas”, hemos descubierto rasgos que explican su historia evolutiva y adaptaciones. Con mis colaboradores, también hemos emprendido estrategias de modelado matemático y metagenómica.


Bernardo Aguilar Salinas
Estudiante de Doctorado
- Enrique Hurtado Bautista, Laura F. Pérez Sánchez, África Islas Robles, Gustavo Santoyo and Gabriela Olmedo Alvarez. Phenotypic plasticity and evolution of thermal tolerance in bacteria from temperate and hot spring environments. Peer J (9): 1-24: 2021. DOI 10.7717/peerj.11734
- Ismael L Hernandez-Gonzalez, Gabriel Moreno-Hagelsieb and Gabriela Olmedo– Environmentally-driven gene content convergence and the Bacillus phylogeny. 2018. BMC Evolutionary Biology, BMC Evolutionary Biology (1)148. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30285626
- Souza, A. Moreno-Letelier, M. Travisano, L. D. Alcaraz, G. Olmedo-Alvarez , L. E. Eguiarte. The lost world of Cuatro Cienegas Basin, a relictual bacterial niche in a desert oasis. eLife7 (2018): e38278. eLIFE eLife 7 (2018): e38278 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30457104
- Jose Antonio González-Gutiérrez, Diana F. Diaz-Jimenez, Itzel Vargas-Peréz, Gabriel Guillen-Solis, Jörg Stülke, Gabriela Olmedo-Alvarez. The DEAD-box RNA helicases of Bacillus subtilis as a model to evaluate genetic compensation among duplicate genes. 2018. Frontiers in Microbiology, section Evolutionary and Genomic Microbiology. Frontiers in microbiology, 9. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6178137/
- Tapia-Torres, y Gabriela Olmedo-Álvarez. Life on phosphite: A metagenomics tale Spotlight. Trends in Microbiology. 26, no. 3 (2018): 170-172. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29402580/
Laboratorio de Genética molecular y ecología microbiana
Departamento de Ingeniería Genética
Cinvestav-Irapuato, Guanajuato.