INVESTIGACIONES ACTUALES

Líneas de Investigación

Origen de genes nuevos. La gran mayoría de los genes se originan mediante la duplicación, recombinación y divergencia a partir de genes ancestrales. Sin embargo, un grupo relativamente reducido de genes se originan de novo a partir de DNA no codificante. En el grupo de Genómica Evolutiva estamos interesados en estudiar genes que se hayan originado a partir de DNA no codificante y entender cuán común es este proceso.

Origen y evolución del palíndromo altamente repetido HIP1. Las cianobacterias poseen un palíndromo octamérico GCGATCGC denominado HIP1 (por sus siglas en inglés: highly iterated palindrome 1). A la fecha, no se entiende cómo se origina ni si cumple una función o no. En el grupo de Genómica Evolutiva estamos interesados en entender su origen y si posee alguna función biológica

Genómica evolutiva. Colaboramos con diversos grupos de investigacion para entender la evolución a nivel genómico de diversos organismos. Recientemente estamos estudiando la epidemiología genómica del SARS-CoV-2, el uso de codones en bacterias y arqueas, la diversidad genómica de la vid y las levaduras de fermentación espontánea en México y la asociación entre la estructura del genoma y la evolución de los genes en la mosca de la fruta.

LuisDelaye

Luis Delaye
Investigador Principal

33

Luis Fernando García Ortega
Profesor Visitante

34

José Norberto García Miranda
Estudiante de Doctorado
(Codirección con la Dra. Gabriela Olmedo)

PersonaGris

Edder Daniel Bustos Díaz
Estudiante de Doctorado

32

Eduardo Padilla Mendoza
Estudiante de Maestría

MujerGris

Karla Isabel García Jiménez
Estudiante de Maestría

PersonaGris

Bryan Eduardo Martínez Pastor
Estudiante de Maestría

  • Draft Genome Sequence of a Kazachstania humilis Strain Isolated from Agave Fermentation.
    García-Ortega LF, Colón-González M, Sedeño I, Santiago-Garduño E, Avelar-Rivas JA, Kirchmayr MR, DeLuna A, Delaye L, Morales L, Mancera E.
    Microbiol Resour Announc. 2022 Mar 17;11(3):e0115421. doi: 10.1128/mra.01154-21. Epub 2022 Mar 2.
  • Evidence of the Red-Queen Hypothesis from Accelerated Rates of Evolution of Genes Involved in Biotic Interactions in Pneumocystis.
    Delaye L, Ruiz-Ruiz S, Calderon E, Tarazona S, Conesa A, Moya A.
    Genome Biol Evol. 2018 Jun 1;10(6):1596-1606. doi: 10.1093/gbe/evy116.
  • Testing the Domino Theory of Gene Loss in Buchnera aphidicola: The Relevance of Epistatic Interactions.
    Martínez-Cano DJ, Bor G, Moya A, Delaye L.
    Life (Basel). 2018 May 29;8(2):17. doi: 10.3390/life8020017.
  • How Really Ancient Is Paulinella Chromatophora?
    Delaye L, Valadez-Cano C, Pérez-Zamorano B.
    PLoS Curr. 2016 Mar 15;8:ecurrents.tol.e68a099364bb1a1e129a17b4e06b0c6b. doi: 10.1371/currents.tol.e68a099364bb1a1e129a17b4e06b0c6b.
  • Evolution of small prokaryotic genomes.
    Martínez-Cano DJ, Reyes-Prieto M, Martínez-Romero E, Partida-Martínez LP, Latorre A, Moya A, Delaye L.
    Front Microbiol. 2015 Jan 6;5:742. doi: 10.3389/fmicb.2014.00742. eCollection 2014.